1936年7月，邓文仪奉调返国，被任命为答复社的书记长、新糊口活动总会总做事。12月12日，西安事情发作。动静传到南京，百姓党统治个人内部一片混乱。亲日的军政部长何应钦等人，死力主张讨伐张、杨，轰炸西安，诡计挑起大范围内战，置蒋介石于死地，以便取而代之。以宋子文、宋美龄为代表的亲英美派，为救援蒋介石，力主战役处理，反对利用武力讨伐张、杨。
邓文仪持续几次劝降陈赓，都以碰了一鼻子灰而终，他以本身极度的利己主义天下观，去度察一个无产阶层军事将领的胸怀，终究是必然要失利的。蒋介石见邓文仪劝降不成，痛骂其无能。但他亲身出马，也以失利而告终。最后，陈赓在宋庆龄等民仆人士的尽力救援下，终究离开了蒋介石的魔掌，重返赤军步队。
二人坐定，酬酢几句，邓文仪刚转入正题，徐培根就起家将办公室反锁，然后回身翻开保险柜，取出一叠现钞，手拿一支手枪，冲着邓文仪开门见山地说：“邓秘书，你也不消查了，我们都是利落人，事已至此，实话实说，这是我派人干的。”
蒋介石回到南京，得知这场闹剧后非常不满，把邓文仪等人找来大发脾气：“我在西安蒙难，你们在南京过逆，坐地打冲锋，娘希屁，我还没有死，你们就不听我的话了，想改换门庭吗？”邓文仪在西安事情中帮了蒋介石的倒忙，被蒋介石以为有贰心之嫌，今后又被萧瑟起来。
暮年研讨玄门，为台湾中华黄埔四海同心会名誉会长，率四海同心会祭祖团回大陆
1926年3月20日中山舰事件产生后，邓文仪大要上不露声色，公开里主动活动，筹办返国。年底，斯大林派共产国际代表罗易到中国指导反动。邓文仪作为从中山大学遴派的40名门生之一随罗易返国，次年2月达到广州。不久，邓文仪便奥妙离开共产国际代表团，跑到南京投奔了蒋介石。他一见蒋介石就剖明说：“我要成为一个受苏俄教诲又转而反对苏俄的人。”蒋介石感觉在邓文仪身上花的心血没有白搭，遂把他留在了身边。
邓文仪在办拔提书店的同时，还采集留苏门生中一些反共分子如王志文、王新衡等人，以研讨苏联的“契卡”、“格柏乌”为借口，动手研讨和筹办建立反共间谍构造。1932年初，他提出了建立这类构造的建议，获得了蒋介石的批准，随即在南昌行营、豫鄂皖三省“剿匪”总司令部及保安行营别离设立以“调查科”或“第二科”称呼呈现的间谍机构。这些间谍机构均以南昌行营的谍报科为总构造，邓文仪为科长。这是军事方面的第一个蒋介石的间谍体系，也是军统的最早家底之一。随后，邓文仪又在各“剿匪”军队以及“剿匪”省分的保安处设立了谍报股，卖力在各军事构造和军队驻地搜捕共产党人，弹压反动活动，并替蒋介石监督“剿匪”军队各级长官以及处所长官。厥后答复社的间谍处建立，邓文仪部下的间谍职员，一概拨归戴笠掌管。
当时，答复社浑家心惶惑，众“太保”惶恐失措。邓文仪刚出任答复社书记长不久，面对如此庞大的情势，更是心急如焚，一筹莫展。在贺衷寒等人的鼓励下，他调集答复社骨干分子，通过了以武力处理西安事情的决定案，并以黄埔同窗会的名义，分歧拥戴何应钦暂代陆海空军总司令，负“讨伐张、杨背叛”之总责。邓文仪和贺衷寒等人还拿着这个决定案去收罗宋美龄的定见，成果被怒斥了一顿，宋美龄说：“这是一个诡计。”但是，邓文仪又亲身跑到上海活动，鼓吹主张战役处理西安事情的人是不识大抵、迟延时候、不忠于魁首的表示。