抗日战役发作后，康泽更遭到蒋介石的重用，又兼任了中心政治黉舍特别练习班主任、军委会政治部第二厅厅长、禁烟督察处缉私主任、战时青年办事总队总队长等要职。并且还卖力批示李香权旅、公秉藩师和张荫梧的河北民军。
因别动队感化特别、职位显赫，很多要员都诡计介入于它。军统头子戴笠曾图谋节制别动队，向蒋介石保荐其亲信黄珍吾为别动队副总队长。后又借口康泽兼职过量，升任黄为代理总队长，一举取康而代之。康泽也不甘逞强，设想把黄珍吾赶走，又重新节制了别动队一个期间，才以其亲信刘伯龙升任总队长。为管束刘伯龙，康泽又晋升亲信马维骥为副总队长兼支队长。1939年别动队被正式改编，大部分编为新编第二十八师和第二十九师，余部编入军法履行总监部法律总队和军政部弥补兵员练习处。新编第二十九师曾任重庆卫戍军队，1941年在滇缅边疆为日军所败。
1938年2月尾，为了给好将召开的百姓党临时天下代表大会做筹办，蒋介石在他的武昌官邸调集康泽、陈立夫等人开会，会上，蒋介石拿出三张名单，一张是党委委员会名单，一张是练习委员会名单，另一张是三民主义青年团筹办委员会名单。在这三张名单上，康泽都名列前茅。蒋介石说：“这三个名单，大师看看，临时全会不搞推举，党里有些精干的青年不能选为中委，是以提出这些人构造党务委员会、练习委员会，以增加构造部和练习部的力量。”由此可见，康泽是被蒋介石看作党国的青年精华而加以重用的。
康泽到成都后，住在位于黄瓦街的妻兄朱兆南的家里，一天到晚车水马龙，三请六宴，高朋满座，不成一世。住在劈面的川军李注东旅官兵看不过眼，有天早晨在康泽乘车返来时，李旅策动俄然攻击，将他的司机和卫兵抓走，康泽在副官易秋泰的庇护下得以脱身。他当晚移住瀛环中学第一中队队部，加强了防备，但仍感不平安，又连夜迁往邓锡侯部下将领家中居住。这是蒋派中心权势和四川处所权势冲突锋利化的表示。两派之间不但武斗，并且文攻。与刘湘合作的张澜写了一篇名为《川人治川》的文章，用以抵抗蒋派权势的渗入。康泽顿时授意尹昌龄写了一篇《异哉所谓川人治川》的文章，对川派权势加以反击。两边唇枪舌剑，互不平气。
1937年天下抗战开端后，蒋介石以“连合抗战”为名，力求扩大构造，棍骗和节制泛博青年，策划建立了“三民主义青年团”。康泽插手了这一构造的酝酿筹建活动。9月中旬，蒋介石在南京陵寝别墅调集康泽、刘健群、陈立夫等开会，对他们说：“现在抗战已经开端了，畴昔奥妙的小组情势分歧需求了，要搞一个大构造，将党部的（指CC系）、同窗的（指答复社）和改组派（指汪精卫派）都连合起来，并以此为中间，再求各党各派的连合和天下的连合，你们去把这个题目研讨一下。”
蒋介石非常赏识康泽的才调，将其别动队调往四川，让他兼任行营参谋团政训处长、四川省保安处政训室主任、四川百姓军训会主任委员和峨嵋军官练习团政训组副组长等要职，把四川方面的事都交给他卖力。