交通司司长王景禄。抗日战役发作后，因为交通停业日趋沉重，连续增设汽车、燃料、经理3个科.
2、大本营
第二部该部于1937年8月20日建立、掌政略。8月20日任命张群为部长：9月11日张他调，任命熊式辉为部长、周佛海、卢作孚为副部长。11月16日该部归并于国度总动员设想委员会。
第三部该部于1937年8月20日建立。先为掌财务金融，后改掌国防产业。8月20日任命孔祥熙为部长。9月11日任命翁文灏为部长，钱昌照、俞大维为副部长.1938年1月该部归并于经济部及其地有关各部。
1938年1月将原大本营第六部、军事委员会政训处、练习总监部政训处归并建立为政治部；1月任命陈诚为部长，2月正式建立。同时任命周恩来、黄琪翔为副部长，是年7月黄琪翔调任军训部副部长，张厉生接任副部长。
侍从室第一处，主任钱大钧。钱于1938年3月调任航空委员会主任，林蔚接任主任。同时，陈希曾接莫我若任第一组组长。兼侍卫长钱大钧调离后，侍卫长一职空缺，王世和接陈善周任第三组组长，并代理副侍卫长：
7、政治部
1、军事委员会
5、军事参议院
1938年1月17日为适应抗战的需求，军事参议院由直隶于gm当局改成隶隶于军事委员会，为军事研讨及建议构造.
军事委员会颠末此次改组、机构根基牢固下来，而后除增加或扩编一些新的机构外，直到抗日战役结束，没有多大窜改.
4、军训部
抗日战役初期百姓党大本营体系
军事委员会内设办公厅。1937年2月17日原主任朱培德病逝；3月6日徐永昌接任主任；1938年1月徐永昌调任军令部部长，贺耀组任主任；
1937年7月抗日战役发作，9月8日军事委员会为整肃军纪，组建军法履行总监部，特派唐生智为总监；9月16日派谷正伦、王懋功为副监。
军事委员会对党政军实施同一批示：军政部由此时归军事委员会批示.1938年1月公布的《军事委员会构造纲领》规定，该部
军法履行总监部，掌理军队规律之保持与军法履行事件.该部下分总务、审判和督察3个组：总务组，掌理该部文电收发．承办文书典守印信、编审预算及经费出纳并碎务和官兵起落开补功过、奖惩告假旷职等各项事项。审判组，并军政部军法司而建立，掌甲士犯法案件考核事项；非甲士犯汉奸、烟毒、盗匪、贪污及其他法律应归军法审判案件之审理、考核事项；关于军法法规检查事项；关于解答法律疑问事项；关于军事犯措置事项；关于该组禁闭人犯收管、戒保护生登记、访问查抄册本函件各事项；关于军法行政事项。督察组，掌前火线文武构造职员违背军事法律之事项；关于考查各级司令部军法处有无枉纵事项；关于消查各地汉奸活动加以制裁事项；关于考查军情战况、交通运输、防空保镳、救保护生及公众构造练习各事项.
1938年初，gmd国防最高集会常务委员会第四十三次集会决定，将原大本营所设第一部与gm当局参谋本部归并构成为军令部。该部于2月1日正式建立，直隶军事委员会，掌国防扶植、处所绥靖及陆海空军之动员作战；火线勤务之筹划应用；谍报及国际政情之汇集清算；参谋职员、陆军大学、测量总局及驻外武官之统辖与应用等事项：以徐永昌为部长，熊斌、杨杰为次长.军令部下设总务落第1、第二3个厅：第一厅掌关于国防作战事件，辖4个处12个科；第二厅掌关于谍报与调派驻外武官及本国武官欢迎等事件，辖4个处12个科及技术室、窥伺电台；总务厅掌关于参谋人事教诲及总务章则等事件,辖3个处6个科。每厅设厅长、副厅长各1人。1938年3月28日任命刘斐为第一厅厅长，徐培根为第二厅厅长，陈焯为总务厅厅长。别的设有部下幕僚,由主任初级参谋、主任秘书及初级副官别离主管各有关停业，即初级参谋掌不属于各厅的秘密及考核章则等事件，部建立以后，任命张华甫为主任初级参谋，张元祜、刘云乾、杨宣诚等18报酬特级初级参谋；主任秘书掌拟各种文牍及部分会报等事件；初级副官掌欢迎中外来宾及传达首要号令等事件.旋因人事、经费无着，仍于2月间前后呈准设将级初级参谋18人，校级参谋40人.6月该部呈奉核定参谋3人，附员80人.