建武二十七年（51年）改大司马为太尉。
三公
汉光武帝即位，置大司马官，卖力天下军官的考核，每岁末，评定等次，上奏天子，作为军官升迁、降调的根据，当时有大司马吴汉。
汉魏期间，有军功者比比皆是，授予官职的难度加大。是以常在“将军”前冠以某个名号以作为他的官职，这类名号并无必然，名号之间也无上下级干系，是以称为杂号将军。临事设置，事毕即撤。如骁骑、楼船、材官、伏波、贰师、度辽、龙骧等，或以所领军队（如骁骑、材官），或因推行的任务（如李广利攻贰师城）。唯度辽将军因南匈奴所部时有内哄，自永平八年（65年）后常设。汉末今后，开端呈现四征、四镇、四平、四安等重号将军。
防盗版，以后改。
以大将军均开府，府属有长史、司马各一人，处置中郎二人，掾属二十九人，令史御属三十一人。将军以本号领军的，各有部曲、校尉。
东汉任命三公多以着名经师为之，以鼓吹经术治国的理念。实在不过是政治花瓶罢了。天子以尚书参决政务，并不以实权付三公。因三公以硕儒经师居官，以是常常要为很小的不对承担非常严峻的任务，以示高节。比方：宋弘为大司空，在位五年，因考核上党太守无所根据而免官。伏湛行大司徒事，以冬祭高庙（汉高祖刘邦的宗庙），因河南尹与司隶校尉在庙中争辩失礼，而伏湛没有上奏此事，免官。汉光武帝对大臣非常峻厉、刻薄，韩歆为司徒，以直言忤旨，免官遣归乡里，与其子皆他杀。以后，欧阳歙、戴涉接踵任大司徒，了局都是论罪下狱、被正法。
司徒
州刺史
东汉沿西汉轨制，以太常、光禄勋、卫尉、太仆、廷尉、大鸿胪、宗正、大司农、少府为九卿。与西汉分歧的是，东汉九卿分附属三公。太常、光禄勋、卫尉三卿属太尉；太仆、廷尉、大鸿胪三卿属司徒；宗正、大司农、少府三卿属司空。
大司马
司空领宗正、少府、司农三卿。司空属吏有长史一人、掾属二十九人、令史及御属四十二人。
与西汉不异的是，刺史也要周行郡国，查探政情，年关回京复奏。不过东汉的刺史不必亲身回京，而是调派属吏向司徒府报送文书罢了。
郡太守秩皆二千石，只要河南郡因京师地点，长官称河南尹，位比九卿，秩中二千石。诸郡各置丞一人，位次太守，秩六百石，卖力民政事件；边郡（就是设置在边疆地区的郡）另置长史一人，秩六百石，卖力军政事件。长史之下有司马一人，卖力详细军事批示。东汉本地不设郡都尉，以太守领兵。边郡置都尉或属都城尉领军并辖县，职位略与本地较小的郡相仿。如汉和帝永元元年（公元89年），置西河属都城尉、上郡属都城尉；永和十五年（公元105年）置辽东西部都尉；汉安帝置右扶风都尉、京兆虎牙都尉等。
按东汉以三公领九卿的轨制，太尉领太常、卫尉、光禄勋三卿。太尉府属吏有：长史一人，秩千石，