书记处：专管行文记要，由萧让任统领。
梁山忠义堂内统统利用之物早已筹办齐备，王伦一到，便被众头领推至居中高位就坐，随后便以卢俊义、柴进为首，带领绿林一众头领领袖站立堂内，向着王伦行大礼参拜，尊呼总盟主。
吴用任梁山军团左总智囊长，统管军机阁参谋处。
军纪处：专责军中法律，奖惩维纪，由曹正任统领。
梁山军团直属的四个独立师，为军团直管军队，由军团总部直接批示。
法律处：专职抓捕违律犯纪之人，由李忠任统领。
堂内其他头领都跟着卢俊义、柴进齐声高呼，连呼了三次，公孙胜也跪回了原处，跟着高呼。
柴进也劝道：“小我荣辱是小，家国百姓为大，还请王总盟主三思。”
有鉴于此，王伦便效仿后代当代中国的纪委监察体系，设立了明镜阁，并建立起呼应配套的法律，以保护绿林梁山的纲常法纪。
绿林政务体系由政务阁卖力办理，现时政务阁暂不设阁正，由王伦亲身执掌，政务阁内设立书记、财务、农渔、掌印、医务、发丘、外事、刑铭八处，
掌印处：专管印信令符，发号施令，由金大坚任统领。
并在军团各部当中，抽调焦挺、黄信、鲍旭、杨春、郑天寿、郁保4、解珍、解宝、吕方、郭盛、项充、李兖、孔明、孔亮等十四报酬宿卫师各团团长。
林冲任军机阁副阁正，兼任梁山军团总教习。
明镜阁内临时设立审判、督察、法律三处。
王伦受了礼，也起家向众兄弟行礼，而后卢俊义居左，柴进在右，二人一齐上前，卢俊义平举太阿剑，柴进手托绿林令，请王伦受领剑、令。
第五军便是本来的梁山川军，现仍由李俊任军长，下辖两个师，别离为原阮小二水军第一师，现改成梁山军团第九师，以及原张顺水军第二师，现改成梁山军团第十师。
军机阁内设立参谋、军情、演训、武选、军纪、驭马、督造七处。
杜迁、宋万、郝默、阿奇、铁木华、纳牙阿仍为王伦贴身保护，铁木华同时兼任参谋处参赞智囊，燕青、乐和也以参赞智囊身份兼任王伦的贴身保护。
军情处：专责刺探军事谍报，刺查敌情，由时迁任统领，白胜为副统领。
公孙胜任梁山军团右总智囊长。
第四军由杨志任军长，下辖两个师，别离为原杨志第五师，现改成梁山军团第七师，并升调原第八师旅长张清任师长，以及原关胜独立第二师，现改成梁山军团第八师。
宿卫师由武松担负师长，参谋处智囊扈成为智囊长，小虎为副师长，下辖十四个团，共一万四千人。
第二军由赵云任军长，下辖两个师，别离为原孙立独立第一师，现改成梁山军团第三师，以及原董平第八师，现改成梁山军团第四师。
第四独立师为原马麟混成第七师，仍由马麟任师长。
卢俊义等人见王伦同意就任总盟主之位，无不大喜过望，当下纷繁上前，也顾不得其他，只将王伦前呼后拥，出了小王庄，直至梁山忠义堂。
王伦又在全军团中抽调精兵强将，构成了独立宿卫师，宿卫师在名分上附属梁山军团，实则独立于梁山军团以外，属于王伦的贴身卫队，由王伦亲身批示。
发丘处：专管探墓寻陵，由石勇任统领。
只因这几年梁山权势生长得过于敏捷，职员构成更是日渐庞杂，不免良莠不齐，违法乱纪，贪污腐蚀，作奸不法之辈累出不断。
农渔处：专管农渔林畜，由陶宗旺任统领。
王伦听卢俊义、柴进二人说完，一时沉吟不语，卢俊义向柴进使个眼色，二人回身回到原地跪下，齐声说道：“请大哥为家国百姓计，早就总盟主之位。”