彭玉麟日夜与黄翼升、李朝斌等人计议，拟出了一个章程：统领之下设提督两员，由黄、李分任；建岳州、汉阳、湖口、瓜洲、狼山五镇，设总兵五人；立营二十四个，战船七百七十四号，营官二十四员，哨官七百七十四员，兵士一万二千人。鉴于海军中受赏大衔的很多，而实际营哨官只要八百来名，僧多粥少，不敷分派，彭玉麟又想出一个点子：以大衔藉补小缺。按衔凹凸排，同衔的按资格排。如许排下去，很多衔位高达参将、游击的，也只能当千总、把总。虽略觉委曲，他们也乐意。衔是空的，职务才是实的，千总、把总虽低，总比那些有衔无职的要强多了。长江海军原有二万人，彭玉麟对这支人马作了清算。没有军功的，疲沓的，私运的，吸食鸦片的，有结党怀疑的，十足予以裁撤。长江海军开端有了新气象。曾国藩对彭玉麟的清算完整放心，他本身则把首要精力放在吏治上。
曾氏在《原才》一文中说："民风之厚薄奚自乎?自乎一二人之心之所向罢了。民之生，庸弱者，戢戢皆是也，有一二贤且智者，则世人君之而受命焉；尤智者，所君尤众焉。此一二人者之心向义，则世人与之赴义；一二人者之心向利，则世人与之赴利。世人所趋，势之所归，虽有大力，莫之敢逆。故曰挠万物者莫疾乎风。民风之于人之心，始乎微，而终乎不成御者也。"他夙来服膺王阳明的"破山中贼易，破心中贼难"的观点，以为君子心、厚民风、窜改世风要比破长毛下金陵更难，而世风的吵嘴首要系于当政者。最高当政者以本身的品德和才气为榜样，默运于渊深微漠当中，渐渐地引发身边人师法，再向天下各级官吏推行，如许便能够构成一种强大的权势。凭着这股权势，民气可朴重，民风可朴素。因此，他本身尽量做到以身作则，试图以此来传染身边的幕僚们，把他们培养成好的种子，撒到两江三省去，影响各府州县的官吏，从而逐步把两江的民风窜改过来。为达此目标，他本身办事比先前更加勤恳。州县凡命案都要由他最后讯断，又常常派幕僚们下去查访吏治民情。继裕祺以后，又革掉了几个民愤很大的赃官，代之以幕僚中德才兼备者。
"左季高目前正在杭州，我本身去走一趟。"彭玉麟自告奋勇，"好几年没见面了，我还蛮想他哩！""太好了！别的几位总督那边，就由我写信。长江海军的事有雪琴摒挡，真比我强多了。"曾国藩放下心来，他佩服彭玉麟的经纬之才，又感激他的仗义之情。