十仲春，吴汉自夷陵将三万人溯江而上，伐公孙述。
初，隗嚣将安宁高大拥兵据高平第一，建威大将军耿弇等围之，一岁不拔。帝自将征之，寇恂谏曰：“长安道里居中，应靠近便，安宁、陇西必怀震惧；此安闲一处，能够制四方也。今士马倦怠，方履险阻，非万乘之固也。前年颍川，可为至戒。”帝不从，戊戌，进幸沠。峻犹不下，帝遣寇恂往降之。恂奉玺书至第一，峻遣智囊皇甫文出谒，辞礼不平；恂怒，将诛之。诸将谏曰：“高大精兵万人，率多强弩，西遮陇道，比年不下，今欲降之而反戮其使，无乃不成乎？”恂不该，遂斩之，遣其副归告峻曰：“智囊无礼，已戮之矣！欲降，急降；不欲，恪守！”峻惶恐，本日开城门降。诸将皆贺，因曰：“敢问杀其使而降其城，何也？”恂曰：“皇甫文，峻之腹心，其所取计者也。今来，辞意不平，必无降心。全之则文得其计，杀之则峻亡其胆，是以降耳。”诸将皆曰：“非所及也！”冬，十月，来歙与诸将攻败落门，周宗、行巡、苟宇、赵恢等将隗纯降，王元奔蜀。徙诸隗于京师以东。后隗纯与来宾亡入胡，至武威，捕得，诛之。
莎车王康卒，弟贤立，攻杀拘弥、西夜王，而使康两子王之。
庚寅，车驾还宫。
是时，朝臣以金城破羌之西，涂远多寇，议欲弃之。马援上言：“破羌以西，城多完牢，易可依固。其田土肥壤，灌溉畅通。如令羌在湟中，则为害不休，不成弃也。”帝从之。民归者三千馀口，援为置长吏，缮城郭，起坞候，开沟洫，劝以耕牧，郡中乐业。又招安塞舅家、羌，皆来降附，援奏复其侯王君长，帝悉从之。乃罢马成军。
夏，先零羌寇临洮。来歙荐马援为陇西太守，击先零羌，大破之。
夏阳节侯冯异等与赵匡、田弇战且一年，皆斩之。隗纯未下，诸将欲且还休兵，异固持不动，共攻落门，未拔。夏，异薨于军。
公孙述以王元为将军，使与领军环安拒河池。六月，来歙与盖延等打击元、安，大破之，遂克下辨，乘胜遂进。蜀人大惧，使刺客刺歙，未殊，驰召盖延。延见歙，因伏哀思，不能俯视。歙叱延曰：“虎牙何敢然！今使者中刺客，无以报国，故呼巨卿，欲相属以军事，而反效后代子涕零乎！刃虽在身，不能勒兵斩公邪？”延收泪强起，受所诫。歙自书表曰：“臣夜人定后，为何人所贼伤，中臣关键。臣不敢自惜，诚恨奉职不称，觉得朝廷羞。夫理国以得贤为本，太中大夫段襄，骨鲠可任，愿陛下裁察。又臣兄弟不肖，终恐被罪，陛下哀怜，数见教督。”投笔抽刃而绝。帝闻，大惊，省书揽涕。以扬武将军马成守中郎将代之。歙丧还洛阳，乘舆缟素临吊、送葬。
建武十一年乙未，公元三五年春，三月，己酉，帝幸南阳，还幸章陵；庚午，车驾还宫。
秋，八月，己亥，上幸长安。
马成等破河池，遂平武都。先零诸种羌数万人，屯聚寇钞，拒浩亹隘。成与马援深切讨击，大破之，徙降羌置天水、陇西、扶风。
帝召寇恂还，以渔阳太守郭伋为颍川太守。伋招降山贼赵宏、召吴等数百人，皆遣归附农；因自劾专命，帝不以咎之。后宏、吴等党与闻伋威望，远自江南，或从幽、冀，不期俱降，骆驿不断。
公孙述使其将延岑、吕鲔、王元、公孙恢悉兵拒广汉及资中，又遣将侯丹率二万馀人拒黄石。岑彭使臧宫将降卒五万，从涪水上平曲，拒延岑，自分兵浮江下还江州，溯都江而上，攻击侯丹，大破之；因晨夜倍道兼行二千馀里，径拔武阳。使精骑驰击广都，去成都数十里，势若风雨，所至皆奔散。初，述闻汉兵在平曲，故遣大兵逆之。及彭至武阳，绕出延岑军后，蜀地动骇。述大惊，以杖击地曰：“是何神也！”延岑盛兵于沅水。臧宫浩繁食少，转输不至，降者皆欲散畔郡邑，复更保聚，张望成败。宫欲引还，恐为所反；会帝遣谒者将兵诣岑彭，有马七百匹，宫矫制取以自益，晨夜进兵，多张旗号，登山鼓噪，右步左骑，挟船而引，呼声动山谷。岑不料汉军卒至，登山望之，大震恐；宫因纵击，大破之，斩首、灭顶者万馀人，水为之浊。延岑奔成都，其众悉降，尽获其兵马珍宝。自是乘胜追北，降者以十万数。军至平阳乡，王元举众降。帝与公孙述书，陈言祸福，示以丹青之信。述省书感喟，以示所亲。太常常少、光禄勋张隆皆劝述降。述曰：“废兴，命也，岂有降天子哉！”摆布莫敢复言。少、隆皆以忧死。