建始二年庚寅，公元前三一年春，正月，罢雍五畤及陈宝祠，皆从匡衡之请也。辛巳，上始郊祀长安南郊。赦奉郊县及中都官耐罪徒；减天下赋钱，算四十。
石显迁长信中太仆，秩中二千石。显既失倚，离权，因而丞相、御史条奏显旧恶；及其党牢梁、陈顺皆免官，显与老婆徙归故郡，忧懑不食，道死。诸所交结以显为官者，皆废罢；少府五鹿充宗左迁玄菟太守，御史中丞伊嘉为雁门都尉。司隶校尉涿郡王尊劾奏：“丞相衡、御史大夫谭，知显等颛权擅势，高文威福，为海内患害，不以时白奏行罚，而恭维曲从，附下罔上，怀邪迷国，无大臣辅政之义，皆不道！在赦令前。赦后，衡、谭举奏显，不自陈不忠之罪，而反扬著先帝任用颠覆之徒，妄言‘百官畏之，甚于主上’；卑君尊臣，非所宜称，失大臣体！”因而衡渐惧，免冠赔罪，上丞相、侯印绶。天子以新即位，重伤大臣，乃左迁尊为高陵令。然群下多是尊者。衡嘿嘿不自安，每有水旱，连乞骸骨让位。上辄以圣旨慰抚，不准。
秋，桃、李实。
建始四年壬辰，公元前二九年春，正月，癸卯，陨石于亳四，陨于肥累二。
上自为太子时，以好色闻；及即位，皇太后诏采良家女以备后宫。大将军武库令杜钦说王凤曰：“礼，一娶九女，以是广嗣重祖也。娣侄虽缺不复补，以是养寿塞争也。故后妃有贞淑之行，则胤嗣有贤圣之君；轨制有威仪之节，则人君有寿考之福。废而不由，则女德不厌；女德不厌，则寿命不究于高年。男人五十，好色未衰；妇人四十，面貌改前；以改前之容侍于未衰之年，而不以礼为制，则其原不成救而后徕异态；后徕异态，则正后自疑，而支庶有间適之心。是以晋献被纳谗之谤，申生蒙无罪之辜。今圣主富于春秋，未有適嗣，方乡术退学，未亲后妃之议。将军辅政，宜因始初之隆，建九女之制，详择有行义之家，求淑女之质，毋必有声色技术，为万世大法。夫少戒之在色，《小卞》之作，可为寒心。唯将军常觉得忧！”凤白之太后，太后觉得故事无有；凤不能自主法度，循故事罢了。凤素重钦，故置之莫府，国度政谋常与钦虑之，数称达名流，裨正阙失；当世善政多出于钦者。
上欲专委任王凤，八月，策免车骑将军许嘉，以特进侯就朝位。
罢中书寺人。初置尚书员五人。三月，甲申，以左将军乐昌侯王商为丞相。
壬子，封舅诸吏、光禄大夫、关内侯王崇为安成侯；赐舅谭、商、立、根、逢时爵关内侯。夏，四月，黄雾四塞，诏博问公卿大夫，无有所讳。谏大夫杨兴、博士驷胜等对，皆觉得“阴盛侵阳之气也。高祖之约，非功臣不侯。今太后诸弟皆以无功为侯，外戚未曾有也，故天为见异。”因而大将军凤惧，上书乞骸骨，辞职。上优诏不准。
孝整天子上之上
张谭坐推举不实，免。冬，十月，光禄大夫尹忠为御史大夫。
夏，上悉召前所举直言之士，诣白虎殿对策。是时上委政王凤，议者多归咎焉。谷永知凤方见柄用，阴欲自托，乃曰：“方今四夷宾服，皆为臣妾，北无熏荤、冒顿之患，南无赵佗、吕嘉之难，三垂晏然，靡有兵革之警。诸侯大者乃食数县，汉吏制其权益，不得有为，无吴、楚、燕、梁之势。百官盘互，亲疏相错，骨肉大臣有申伯之忠，洞洞属属，谨慎畏忌，无重合、安阳、博陆之乱。三者无毛发之辜，窃恐陛下舍昭昭之白过，忽六合之明戒，听晻昧之瞽说，归咎乎无辜，倚异乎政事，重失天心，不成之大者也。陛下诚深察愚臣之言，抗湛溺之意，解偏驳之爱，奋乾刚之威，平天覆之施，使列妾得大家更进，益纳宜子妇人，毋择好丑，毋避尝字，毋论年齿。推法言之，陛下得继嗣于寒微之间，乃反为福；得继嗣罢了，母非有贱也。后宫女史、使令有直意者，广求于寒微之间，以遇天所开右，慰释皇太后之忧愠，解谢上帝之谴怒，则继嗣蕃滋，灾异讫息！”杜钦亦仿此意。上皆以其书示后宫，擢永为光禄大夫。