诸将围洛阳数月，朱鲔死守不下。帝以廷尉岑彭尝为鲔校尉，令往说之。鲔在城上，彭在城下，为陈成败。鲔曰：“大司徒被害时，鲔与同谋，又谏更始无遣萧王北伐，诚自知罪深，不敢降！”彭还，具言于帝。帝曰：“举大事者不忌小怨。鲔今若降，官爵可保，况诛罚乎！河水在此，吾不食言！”彭复往告鲔，鲔从城高低索曰：“必信，可乘此上。”彭趣索欲上，鲔见其诚，即许降。辛卯，朱鲔面缚，与岑彭俱诣河阳。帝解其缚，召见之，复令彭夜送鲔归城。明旦，与苏茂等悉其众出降。拜鲔为平狄将军，封扶沟侯；后为少府，传封累世。帝使侍御史河内杜诗安集洛阳。将军萧广纵兵士暴横，诗敕晓不改，遂格杀广。还，以状闻。上召见，赐以棨戟，遂擢任之。
己亥，帝幸怀，遣耿弇、陈俊军五社津，备荥阳以东；使吴汉率建义大将军朱祜等十一将军，围朱鲔于洛阳。八月，进幸河阳。
上遣岑彭击荆州群贼，下犨、叶等十馀城。十一月，甲午，上幸怀。
辛未，诏封更始为淮阳王；吏民敢有贼害者，罪同大逆；其送诣吏者封列侯。
十仲春，丙戌，上还洛阳。
三辅苦赤眉残暴，皆怜更始，欲盗出之；张卬等深觉得虑，使谢禄缢杀之。刘恭夜往，保藏其尸。帝诏邓禹葬之于霸陵。中郎将宛人赵熹将出武关，道遇更始支属，皆裸跣饥困，熹竭其资粮以与之，将护而前。宛王赐闻之，迎回籍里。
冬，十月，癸丑，车驾入洛阳，幸南宫，遂定都焉。
邓禹自汾阴渡河，入夏阳，更始左辅都尉公乘歙引其众十万，与左冯翊兵共拒禹于衙；禹复破走之。
赤眉进至华阴，军中有齐巫，常鼓励祠城阳景王，巫大言：“景王大怒曰：‘当为县官，何故为贼！’”有笑巫者辄病，军中轰动。方望弟阳说樊崇等曰：“今将军拥百万之众，西向帝城，而无称呼，名为群贼，不成以久。不如立宗室，挟义诛伐，以此号令，谁敢不从！”崇等觉得然，而巫言益甚。前至郑，乃相与议曰：“今逼近长安，而鬼神若此，当求刘氏共尊立之。”
邓禹围安邑，数月未下，更始大将军樊参将数万人度大阳，欲攻禹。禹逆击于解南，斩之。王匡、成丹、刘均合军十馀万，复共击禹，禹军倒霉。明日，癸亥，匡等以六甲穷日，不出，禹因得更治兵。甲子，匡悉军出攻禹。禹令军中无得妄动，既至营下，因传发诸将，鼓而并进，大破之。匡等皆走，禹追斩均及河东太守杨宝，遂定河东，匡等奔还长安。
萧王北击尤来、大枪、五幡于元氏，追至北平，连破之；又战于顺水北，乘胜轻进，反为所败。王自投高岸，遇突骑王丰上马授王，王仅而得免。散兵归保范阳。军中不见王，或云已殁，诸将不知所为，吴汉曰：“卿曹尽力！王兄子在南阳，何忧无主！”众惊骇，数日乃定。贼虽克服，而惮王威名，夜，遂引去。雄师复追至安次，连战，破之。贼退入渔阳，所过虏掠。强弩将军陈俊言于王曰：“贼无辎重，宜令轻骑出贼前，使百姓各自坚壁以绝其食，可不战而殄也。”王然之，遣俊将轻骑驰出贼前，视人保壁坚完者，敕令恪守；放散在野者，因掠夺之。贼至，无所得，遂散败。王谓俊曰：“困此虏者，将军策也。”
宗室刘茂聚众京、密间，自称厌新将军，攻陷颍川、汝南，众十馀万人。帝使骠骑大将军景丹、建威大将军耿弇、强弩将军陈俊攻之。茂来降，封为中山王。