最后魁玉、张之万上奏说：“张汶祥矢口不移其供，只是因私对马心胸仇恨，为朋友报仇，为本身泄愤，无另有主使各情，尚属可托。”并以此拟科罪名结案。
江宁将军魁玉会同藩台梅启照等人审判刺客张汶祥。几天后，又加派漕运总督张之万参与审判。
而郑敦谨是刑部主官，夙来有“铁面忘我”的称呼。他受命时正值寒夏季候，大雪隔绝，车马不能行，郑即与两个郎中徒步踏雪而行，赶赴江宁，路程四十一天，大年月朔方到江宁，第二天就关门审案。
清当局令时任两江总督的曾国藩查报承平天国留下的金银财宝，曾国藩上奏说，破天京时，天王府一场大火烧得片瓦无存，没有留下甚么财宝。对此清廷心存疑虑，很想查清，又不敢获咎湘军个人，处于两难地步。
慈禧在此事以后也仰天长叹，这件事也形成了过后李鸿章的崛起，她晓得，曾国藩和湘军是不能再用了……
其间清廷大裁军，湘军被迫裁军数万，裁下的湘军官兵并未回湘，原在湘军中“哥佬会”大行，裁下后就变成了处所上的黑权势，与湘军、官府勾搭，无恶不作，给社会带来不稳。马新贻镇~压了一批处所黑权势，打击了湘军的“处所别动队”。
这此中，马新贻实授闽浙总督，在进京陛见请训时，曾前后十余次被召见，最后一次是慈禧太后在养心殿住处召见。
召见后马新贻退出来，时价六月，马新贻大汗淋漓，朝服都被浸湿，满面惊骇。据马新贻的先人说，慈禧太后授以密旨，要其刺探承平天国金银财宝下落。马新贻深知此事极其严峻，极其凶恶，故此失态。
张汶祥口中不断地叫唤：“养兵千日，用兵一时。”“有来有去。”“大丈夫一人做事一人当。”“二十年后又是一条豪杰。”
此数人借口案情严峻，拖沓光阴，也不对刺客用刑，借口是：“案情严峻，徒事刑求，倘未正典刑而庾死，谁任其咎？”
承平天国在南边纵~横十余年，堆集了大量的金银财宝，大部分囤积在天京。湘军攻破天京，这些金银财宝被湘军劫掠一空，自曾国荃以下，大家发了大财，回籍买田宅，置财产，国人侧目。
而清廷也并不信赖魁玉、张之万的“拟科罪名”，即谕令曾国藩敏捷回任两江总督，并加派刑部尚书郑敦谨为钦差大臣，照顾刑部两名郎中（即满人郎中伊勒通阿、汉人郎中颜士璋）马上赴江宁复审。
话说马新贻此人也很奇特，人家都说他“薄绩高官”就是说他没有多少政绩却当了一方要员，这倒是一句实话，就连马新贻本身对此也是战战兢兢。不过他的首要政绩是到了两江总督的位子上才有的，这也是让朝廷对他比较对劲的处所。
再有，马新贻任两江总督两年，干了很多实事，能够最为关头的一点是暗中查湘军的的账目，这但是触怒了很多人，但如何查的案，无据可查。
刑部两个郎中回京后不久就悄悄离京，汉郎中颜士璋被放兰州知府但是并无实缺，贫苦得志，西北大帅左宗棠出身湘军，深知此中黑幕，对颜无辜受过非常怜悯，令其军中帮办。满郎中伊勒通阿“给全俸以养天年”，回故乡去了。
郑敦谨自行弃官回籍，毕生不再为官。郑彼苍何尝不晓得此中的短长，但做了愿意之事也让贰心中忸捏，永不致仕也是一种心中惭愧的表示。
结案奏章以四百里加急进京，未等圣旨下达，郑敦谨即携两个郎平分开江宁。曾国藩依例奉上“程仪”，郑分文未取，两个郎中各受纹银500两。