六月十九日，又遣内臣监督苏、杭织造。
十仲春初三，大学士赵志皋等人要求批留在宫禁中的奏章，未得答复。
六月初六，以云南用兵为由，免除税粮及拖欠赋役。
六月二旬日，松茂番被安定。这年夏天，施助直隶、河南、陕西及广西浔、柳、平乐，广东琼山等十二县饥荒。山西始闹盗贼。
秋七月初六，朱翊钧诏谕吏、户二部清理吏治，并别离免除所欠赋税，折非常之三成收取来岁漕运粮。十一日，又调派御史督修江、浙水利。十三日，兴建泗州祖陵。二旬日，完成草湾黄河工程。
玄月二十六日，中断行刑。
冬十月二十二日，因议论张居正因父丧事而穿素服办公、不插手吉礼一事，编修吴中行、检验赵三贤、员外郎艾穆、主事沈思孝等皆受杖刑，并别离被夺职和废黜，乃至遭到贬谪和戍边。二十四日，进士邹元标被杖击，进而将其戍边。
仲春十四日，派人分头巡查边防。
这一年，有安南、琉球、暹罗、土鲁番前来朝贡。
夏四月初九，查抄张居正家。十一日，游击将军刘纟廷讨伐安定陇川贼寇。
这一年，有暹罗、土鲁番前来朝贡。
冬十月初八，土蛮进犯广宁、义州，李成梁将其击退。
夏四月月朔，日蚀，为日全食。初四，翊钧誊写谨天戒、任贤达、亲贤臣、远嬖佞、明奖惩、谨出入、慎起居、节饮食、收放心、存畏敬、纳忠告、节财用十二事置于座右边，以期自警。
三月初三，礼部尚书马自强兼任文渊阁大学士，吏部侍郎申时行兼任东阁大学士，参与秘密事件。十三日，张居正因安葬父亲而回籍。
秋七月十六日，免除陕西拖欠赋税。十七日，副总兵祖成训率兵援救朝鲜，在平壤与倭寇交兵，败北。二十七日，夺职三边总督魏学曾，以叶兰梦取而代之，不久拘系魏学曾，打进监狱。
玄月初六日，朱翊钧到天寿山拜见祖陵，十一日回宫。
三月十八日，赐赉沈懋学等为进士落第以及其他分歧的出身。
■万历十五年(1587)春正月初三，分国库所藏的金帛以施助山西、陕西、河南、山东各地宗室。
十仲春二十二日，慈庆宫受灾，诏谕修身检验。当年，有琉球前来朝贡。
六月十七日，查对两畿、山东、陕西等地勋官、皇戚的田赋。
蒲月，大清太祖高天子起兵挞伐尼堪外兰，霸占图伦城。
六月月朔，日蚀。初十，朱翊钧担当天子之位。定第二年为万历元年，颁诏大赦天下。在乡间祭奠建文朝尽节诸臣，有子孙后代的加以恤录。十六日，夺职高拱。二十三日，高仪死去。二十八日，礼部尚书吕调阳兼任文渊阁大学士，参与秘密事件。
玄月月朔，朱翊钧因得皇宗子而颁诏大赦天下。初九，上两宫皇太后徽号。
夏四月十六日，潮、惠贼寇被安定。二十一日，天大旱，谕百官修身检验。
■万历十三年(1585)春正月十九日，四川建武所兵变，击伤总兵沈思学。
秋八月十一日，京师地动。
十一月十四日，祭奠天于南郊。
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六月初十，禁令廷臣豪侈。当月，京师连降大雨，朝廷施助抚恤穷户百姓。
秋八月二十七日，严申匿名揭禁令。
玄月二十三日，京师生地动。
玄月十三日，事奉两宫皇太后到天寿山拜见皇陵。十六日，制作寿宫。二十一日，返回宫中。
闰仲春十一日，俺答之子乞庆哈世袭顺义王封号。缅甸侵犯永昌。十二日，朱翊钧到天寿山进谒九陵，免除路过之地的田租。十七日，又到西山进谒恭让章皇后、景天子之陵。十八日回宫。乙酉日，施助临、巩、平、延、庆五府水灾，免除其田租。