建武二十三年丁未，公元四七年春，正月，南郡蛮叛；遣武威将军刘尚讨破之。
初，援尝有疾，虎贲中郎将梁松来候之，独拜床下，援不答。松去后，诸子问曰：“梁伯孙，帝婿，贵重朝庭，公卿已下莫不惮之，大人何如独不为礼？”援曰：“我乃松父友也，虽贵，何得失其序乎！”援兄子严、敦并喜讥议，通轻侠，援前在交趾，还书诫之曰：“吾欲汝曹闻人不对，如闻父母之名，耳可得闻，口不成得言也。好论议人是非，妄是非政法，此吾所大恶也，宁死，不肯闻子孙有此行也。龙伯高浑厚周慎，口无择言，谦约俭仆，廉私有威，吾爱之重之，愿汝曹效之。杜季良豪侠好义，忧人之忧，乐人之乐，父丧致客，数郡毕至，吾爱之重之，不肯汝曹效也。效伯高不得，犹为谨敕之士，所谓‘刻鹄不成尚类鹜’者也；效季良不得，陷为天下轻浮子，所谓‘画虎不成反类狗’者也。”伯高者，山都长龙述也，季良者，越骑司马杜保也，皆京兆人。会保仇敌上书，讼“保为行佻达，乱群惑众，伏波将军万望还书以诫兄子，而梁松、窦固与之交结，将扇其轻伪，败乱诸夏。”
建武二十六年庚戌，公元五零年正月，诏增百官奉，其千石已上，减于西京旧制，六百石已下，增于旧秩。
秋，七月，武陵蛮寇临沅。遣谒者李嵩、中山太守马成讨之，不克。马援请行，帝愍其老，未许，援曰：“臣尚能被甲上马。”帝令试之。援据鞍顾眄，以示可用，帝笑曰：“矍铄哉是翁！”遂遣授率中郎将马武、耿舒等将四万馀人，征五溪。援谓朋友杜愔曰：“吾受厚恩，年迫日索，常恐不得死国事。今获所愿，甘心瞑目，但畏父故乡儿或在摆布，或与处置，殊可贵调，介介独恶是耳！”
夏，南单于所获北虏薁韐左贤王，将其众及南部五骨都侯合三万馀人畔归，去北庭三百馀里，自主为单于。月馀，日更相进犯，五骨都侯皆死，左贤王他杀，诸骨都侯子各拥兵自守。秋，南单于遣子入侍。诏赐单于冠带、玺绶、车马、金帛、甲兵、什器。又转河东米糽二万五千斛，牛羊三万六千头以赡给之。令中郎将将弛刑五十人，随单于所处，参辞讼，察动静。单于岁尽辄遣奉奏，送侍子入朝，汉遣谒者送前侍子还单于庭，赐单于及阏氏、左、右贤王以下缯彩合万匹，岁觉得常。因而云中、五原、朔方、北地、定襄、雁门、上谷、代八郡民归于本土。遣谒者分将弛刑，补治城郭，发遣边民在中国者布还诸县，皆赐以装钱，转给粮食。时城郭丘墟，扫地更加，上乃悔前徙之。
冬，十月，匈奴日逐王比自主为南单于，遣使诣阙奉藩称臣。上以问朗陵侯臧宫。宫曰：“匈奴饥疫分争，臣愿得五千骑以建功。”帝笑曰：“常胜之家，难与虑敌，吾方自思之。”
上问赵熹以悠长之计，熹请遣诸王就国。冬，上始遣鲁王兴、齐王石就国。是岁，帝舅寿张恭侯樊宏薨。宏为人谦柔畏慎，每当朝会，辄迎期先到，俯伏待事；所上便宜，手自誊写，毁削草本；公朝访逮，不敢众对。宗族染其化，何尝犯法。帝甚重之。及病困，遗令薄葬，一无所用。觉得棺柩一藏，不宜复见，如有败北，伤孝子之心，使与夫人同坟异藏。帝善其令，以书示百官，因曰：“今不顺寿张侯意，无以彰其德；且吾万岁以后，欲觉得式。”
匈奴八部大人共议立日逐王比为呼韩邪单于，款五原塞，愿永为藩蔽，扦御北虏。事下公卿，议者皆觉得：“天下初定，中国空虚，蛮夷情伪难知，不成许。”五官中郎将耿国独觉得：“宜如孝宣故事，受之。令东抜鲜卑，北拒匈奴，率厉四夷，完复边郡。”帝从之。