十仲春，乙卯，以颍川太守张敏为司空。
壬寅，司徒鲁恭罢。恭再在公位，选辟高第至列卿、郡守者数十人，而门下耆旧或不蒙荐举，至有怨望者。恭闻之，曰：“学之不讲，是吾忧也，诸生不有乡举者乎！”终无所言，亦不借之群情。学者受业，必穷核答辩，道成，然后谢遣之。学者曰：“鲁公谢与群情，不成虚得。”
三月，甲申，葬孝和天子于慎陵，庙曰穆宗。
乙酉，罢鱼龙曼延戏。
九真徼外、夜郎蛮夷，举土内属。
十仲春，广汉塞外参狼羌降。
冬，十月，四州大水，雨雹。
蜀郡徼外羌内属。
己卯，永昌徼外僬侥种夷陆类等举种内附。
秋，玄月，午，太尉徐防以灾异，寇贼策免。三公以灾异免，自防始。辛未，司空尹勤以水雨漂流策免。
丙戌，清河王庆、济北王寿、河间王开、常山王章始就国；太后特加庆以殊礼。庆子祜，年十三，太后以帝幼弱，远虑不虞，留祜与嫡母耿姬居清河邸。耿姬，况之曾孙也；祜母，犍为左姬也。
初，烧当羌豪东号之子麻奴随父来降，居于安宁。时诸降羌布在郡县，皆为吏民豪右所徭役，积以愁怨。及王弘西迎段禧，发金城、陇西、汉阳羌数百千骑与俱，郡县迫促发遣。群羌惧远屯不还，行到酒泉，很有散叛，诸郡各出兵邀遮，或覆其庐落；因而勒姐、当煎大豪东岸等愈惊，遂同时奔溃。麻奴兄弟是以与种人俱西出塞，先零别种，滇零与锺羌诸种大为寇掠，断陇道。时羌归附既久，无复器甲，或持竹竿木枝以代戈矛，或负板案觉得榡，或执铜镜以象兵，郡县畏懦不能制，丁卯，赦除诸羌相保持谋背叛者罪。
冬，邓骘使任尚及处置中郎河内司马钧率诸郡兵，与滇零等数万人战于平襄，尚军大败，死者八千馀人，羌众遂大盛，朝廷不能制。湟中诸县，粟石万钱，苍存亡亡不成胜数，而转运难剧。故左校令河南庞参先坐法输作若卢，使其子俊上书曰：“方今西州流民扰动，而征发不断，水潦不沐，地力不复，重之以雄师，疲之以远戍，农功消于转运，资财竭于征发，田畴不得垦辟，禾稼不得支出，搏手困穷，有望来秋，百姓力屈，不复堪命。臣愚觉得万里运粮，远就羌戎，不若总兵养众，以待其疲。车骑将军骘宜且振旅，留征西校尉任尚，使督凉州士民转居三辅，休徭役以助当时，止烦赋以益其财，令男得耕作，女得织纴，然后畜精锐，乘懈沮，出其不料，攻其不备，则边民之仇报，奔北之耻雪矣。”书奏，会樊准上疏荐参，太后即擢参于徒中，召拜见者，使西督三辅诸军屯。十一月，辛酉，诏邓骘还师，留任尚屯汉阳为诸军节度。遣使迎拜骘为大将军。既至，使大鸿胪亲迎，中常侍郊劳，王、主以下候望于道，宠灵显赫，光震都鄙。
封皇兄胜为平原王。
永初三年己酉，公元一零九年春，正月，庚子，天子加元服，赦天下。
汉纪四十一（起柔兆敦牂，尽旃蒙单阏，凡十年）
三公以国用未足，奏令吏民入钱谷得为关内侯、虎贲、羽林郎、五官、大夫、官府吏、缇骑、营士各有差。
丙寅，葬孝殇天子于康陵。以连遭大忧，百姓苦役，方中秘藏及诸事情事，事减约非常家一。
蒲月，甲戌，以长乐卫尉鲁恭为司徒。恭上言：“旧制，立秋乃行薄刑，自永元十五年以来，改用孟夏。而刺史、太守因以隆冬征召农夫，拘对磨练，连滞无已。上逆时气，下伤农业。按月令‘孟夏断薄刑’者，谓其轻罪已正，不欲令久系，故时断之也。臣愚觉得今孟夏之制，可今后令。其决狱案考，皆以立秋为断。”又奏：“孝章天子欲助三正之微，定律著令，断狱皆以冬至之前。小吏不与国同心者，率入十一月得极刑贼，不问曲直，便即格杀，虽有疑罪，不复谳正。可令大辟之科，尽冬月乃断。”朝廷皆从之。