而兵部此次官制变动最惹人谛视标就是兵部之下设立的兵甲司和后勤司，这两个司部承担的职责便是把各军统军将领手中的权力剥了过来，赋税甲器一应军中所需此后由户部这两个司承担，就不再是一军将领掌控全军的赋税甲器了。这也是三娘早早的把制止部下将领坐大的手腕使了出来，只要节制住一军的赋税甲器命脉，再强的将领也不能掀起甚么风波来，这也意味着三娘对天下军队的节制更加松散了，此后军队便是国度的军队而不是哪一个将领的军队了。
扈元朝将处所行政体系也做了窜改，将宋朝的一起行政单位改成行省，比如山东路改成山东行省，三娘还是风俗用行省分别处所行政地区，而没有相沿宋朝的甚么一起军州。行省之下便是府，府之下是州，州之下是县，县之下是乡，乡之下便是村。三娘在处所管治上一改前朝通病，那便是县以下便没有很好的管治，多是乡民自治。扈元朝在县之下还设了乡和村两级单位，乡长和村长普通也是由村民本身推举，不过朝廷插手了监察和政绩考核，同时也给朝廷俸禄，对县以下更小的处所行政也有效管治了起来。
而一应女军们也在朝中设了官职，答应女子出任朝中官职，固然朝廷答应女子出任官职，但真正在朝廷任职的也只是琼英、孙二娘、庞秋霞、顾大嫂等跟从三娘起家的女将，很少有女子真正通过科举测验仕进的。直到厥后三娘之子扈宗明继位后的第五年上，才正式有第一名元朝女子正端庄经通过科举仕进的，到扈宗明即位十年后才呈现了第一名科举女状元，那都是二三十年以后的事了。
扈岚得承帝位，诏命群臣，建号大元，定都燕京为中京，仿宋例定五京，以会宁府为北京，开封为南京，山东济州府本身起家之地为东京，山西太原府为西京。三娘定五京，初次有关外州府为京，又将都城定在燕京，显现了她想要节制北地，完整断绝来自漠北游牧族的威胁。
宋建炎元年蒲月，大宋北伐军班师陈桥驿，三大主将领全军十余万将士奏请天子禅位鲁王，宋朝最后一名天子，第一名女天子赵嬛嬛欣然应允，颁下禅位圣旨，祭告宗庙后，便将帝位传位鲁王扈岚。
扈元朝的中书省自中书令以下，实权人物共有十人，便是替天子掌控天下军政大事的中枢，中书省也被后代称为十人内阁，得入中书省的都顶着各殿大学士的名号，后为常例。
其他梁山老兄弟都是武将出身，三娘在天下设立了东西南北中五雄师区，卖力统领天下兵马，卖力戍边和保卫处所。其他梁山武将及田虎、方腊麾降落将都在五雄师区以内担负军职，其间就不一一赘述。总之三娘为跟从本身的一干老兄弟都安排好了，除了担负军职以外，三十六天罡正将都按军功封了侯爵或伯爵之位，其他将佐或封男爵、子爵，都有爵位封赏。
工部的职司除了之前的兴建水利、修桥铺路、营建屋宇、宫殿、城垣以外，三娘新设了火器司、船舶司、机器司三个司部。火器司就是卖力制造、研发各种火器、火炮、火药的司部，该司部早在山东路时就存在，当时的山东路的工匠们都被集合到一起，专门补葺火器和配制火药，现在只是正式挂牌罢了。船舶司也是在山东路时就有，卖力办理船只、制作船只。同时船舶司还要该管内河航运来往的各种船舶，也算是江海事局的前身。机器司卖力的事也很多，从矿产勘察到开采、冶炼，以及各种机器的制造等等。