军机阁专管梁山军务，内设四周，别离为参谋处、军法处、督造处、军情处、
第二师一团为玄甲重骑团，由原梁山军团具装重骑营扩大构成，邹渊任团长；二团为陷阵重骑团，由原梁山军团普装重骑营扩大构成，邹润任团长；三团为轻骑团，由原梁山军团轻骑营扩大构成，吕方任团长；四团为弓骑团，由原梁山军团弓骑营扩大构成，郭盛任团长；四个团各下辖十个连一千人。
汤家历代名匠辈出，锻造大师无数，打造的神兵利器更是不知凡已，江湖豪侠，武林妙手，无不以能够具有一件汤家所铸的神兵为荣。
农渔处由陶宗旺卖力，专管农渔林畜。
发丘处由石勇卖力，专管探墓寻陵。
财务处由蒋敬卖力，专管赋税账目。
王伦也晓得杜、宋二人实在不是带兵的质料，便让他二人与郝默、阿奇一样，做了本身的贴身侍卫。
梁山军团独立二旅为混成旅，由绿林各部精锐、归降官军以及梁山军团部分精锐构成，下辖五个团，共五千人，马麟任旅长。
水战师别离于梁山川泊的东、西、北三处设下水寨，由阮氏三雄分任旅长，一旅驻扎水泊正北鸭嘴滩水寨，下辖八个营，共四千人，由阮小二任旅长；二旅驻扎水泊正西金沙岸水寨，下辖六个营，共三千人，由阮小五任旅长；三旅驻扎水泊正东浮萍滩水寨，下辖六个营，共三千人，由阮小七任旅长。
绿林梁山军团整编结束，晁盖又授意王伦将梁山政务、军机二阁也停止了重新编组，政务、军机二阁各设阁正一人，由公孙胜任政务阁阁正，吴用任军机阁阁正。
但天有不测风云，就在数年前，朝廷新派下一名军器督造官，接办督办军器征调之事，而这位新任的督造官倒是过分贪腐，不但死力压榨汤家接办官造的利润，更是常常向汤家索要贿赂。
军法处由裴宣卖力，专管军规法纪，监察奖惩。
梁山军团第四师为步战师，由史进任师长，下辖两个旅及四个团，由绿林各部精锐、归降官军以及原梁山军团部分精锐构成，总计一万人。
这三人中除凌振外，饮马川的汤隆是延安府“分金”汤家的当代主事人，汤家最擅打造各种兵器利刃，可称当代大宋铁匠一行的第一世家。
书记处由萧让卖力，专管行文记要。
梁山虽是不大，但也是五行八作一应俱全，这些官军降卒或是捕鱼种地，或是做工做侍，倒是很快便极其天然地融入了梁山。
现在梁山之上豪杰堆积，豪杰聚会，自晁盖、王伦以下，无不是当世英才，而最令人不测的，倒是竟然堆积了神机八大师族当中七个家属的人。
梁山军团独立一旅为近卫旅，是王伦的直属军队，赵云任旅长，由原梁山军团侍卫团精锐以及绿林各部精锐构成，下辖五个团，共五千人。
独立二旅一团战车团，由原梁山军团战车营扩大构成，欧鹏任团长；二团为机弩团，由原梁山军团机弩营扩大构成，邓飞任团长；三团为辎重团，由原梁山军团辎重营扩大构成，李忠任团长；四团为火炮团，由原凌振所部火炮手以及绿林各部抽调人手构成，凌振任团长；五团为突火团，由原凌振所部火铳手以及绿林各部抽调人手构成，汤隆任团长；五个团各下辖十个连一千人。
实在王伦本不想再为本身装备直属军队，但晁盖执意不肯，言明王伦现在已经身为天下绿林副总盟主，身边岂能没有亲卫，王伦推让不成只得应允。
几次三番下来，汤隆被逼得实在没法，便在一怒之下去官不做，带领全族入了绿林盟，此次便也随晁盖上了梁山。