他的第八大誓愿是：惟愿在未来世，当我得以成绩无上正等正觉时，如有女人因为女子才有某种缺点所折磨忧?，从而生出厌离女身的意念，但愿舍弃女性特性，转为男身，她们只要闻声我的名号，便能够立转女为男，并具有大乘菩萨的大丈夫相，乃至是以而证得无上正等菩提。
假定另有不能舍弃罪过恶见而修习正法的众生，但只因为有了那药师如来的本愿能力，使他们当下现前得闻药师琉璃光如来的名号，从而结束恶趣生命，转生人间，得以住于正见，精学习习，善能调伏内心的意乐，从而能够舍离家庭，削发求道，在如来教诲的各种正法中，受持诸种戒律法轨而无所毁犯；从正观点缆，寻求多闻，尽力体味契经的深切含义，丢弃自发得是的增上慢心，不再毁犯正法，不再与魔为伍，循序渐进地修习菩萨六度万行，以期敏捷获得美满果德。
文殊师利啊!那位药师琉璃光以来世尊，在当初发心修菩萨行的时候，就许下了十二个弘大誓愿，必然要使统统众生的祈愿都获得满足。
再者，文殊师利!那药师琉璃光如来在成绩大菩提正觉时，因为其在菩萨因地时所发本愿的力量，他便能够以慈悲之眼察看人间有情，遇众生有无量多的痛苦，如像羸瘦肺劳、糖尿渴症、黄疸肝病等等；或者遇见众生被魔厌所扰、被蛊毒所伤；或者有的短折，有的非命；但药师如来会发大慈悲，要让统统众生的病痛磨难皆得毁灭，让他们祈求消灾弥难的统统欲望都得满足。由此愿心，那药师琉璃光如来便入三摩地定，要为施设便利而说神咒。那药师琉璃光如来所入的定又叫"除灭统统众生忧?定"。
他的第四大誓愿是：惟愿在未来世，当我得以成绩无上正等正觉时，若人间另有推行邪门外道的有情众生，则必然让他们安然进入憬悟之菩萨道；而那些推行声闻和独觉摆脱道法的人，都必然要使他们依傍大乘而得安立。
但仅仅因为他们往昔在人间传闻过药师琉璃光如来的名号，以是明天在恶趣当中，因遭受痛苦而忆起药师如来的名号。就在他作此忆念的时候，使结束了三恶道的保存状况，敏捷地转生于人间，生于人间以后，根据对宿世的忆念，又怀着对恶趣的惊骇，不以五欲之乐为乐，且欢乐多行恩赐，好处别人；又能赞叹那些肯作恩赐的人；对本身统统的人间资财悉地贪惜，进一步还能够以本身的头颅、眼目、手脚、血肉和身材的任何部分，毫不怜惜地恩赐给祈求者，至于说到普通的财帛，就更不会舍不得放弃了。
文殊师利说：我等服从，唯愿世尊为我们演说开示，我们乐于听闻领受。
而那些受人毒害的有情众生，如果得以听闻药师如来的名号，则上面所说的各种恶事都不能侵犯于他们。统统瞠害恼人者的歹意也就呼应化解，仇家之间反而生出慈决定，不竭促进各种好处，共共享有安乐，相互摆脱损恼意和嫌恨心，发慈言爱语而使各各生出欢乐愉悦的心，对本身所遭受的处境毫无牢骚，反倒生出了高兴和满足的表情，相互之间天然不会再侵害欺侮，而能相互饶益。
他的第一大誓愿是：惟愿在未来世，当我得以成绩无上正等正觉时，本身的身材成为光亮火把，熊熊燃烧，晖映无量无边的天下，使统统众生都像佛陀一样，具有夸姣寂静的身形相貌，也有三十二种大人相，和八十种随形好。